Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBOX1C9JBD0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms