Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DXG7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B4DXG7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
B4DXG7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
B4DXG7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
B4DXG7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B4DXG7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms