Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms