Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCE3A1L190 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCE3A1L190 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms