Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFCAB13-203ENST00000517484 3466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA6D-202ENST00000618219 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF200-204ENST00000414144 3306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN3-202ENST00000335750 2764 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRP3-201ENST00000402538 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024610.2-204ENST00000637478 2867 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC37A3-211ENST00000584306 5665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP4-201ENST00000301295 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM2A-212ENST00000530342 3651 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF19-204ENST00000611931 2051 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBS9-202ENST00000350941 3899 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CICP22-201ENST00000432801 1319 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MROH5-205ENST00000621837 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPCML-207ENST00000541867 6277 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AHNAK2-204ENST00000557457 3436 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSUN7-201ENST00000316607 3546 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13A-220ENST00000513837 2590 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF160-214ENST00000601421 4688 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF2-202ENST00000611463 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF34P-201ENST00000483587 4532 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NMNAT1-201ENST00000377205 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAPVD1-219ENST00000495955 5309 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARMIL1-201ENST00000329474 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCHO2-202ENST00000430046 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLGN4X-208ENST00000538097 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP3K9-202ENST00000553414 3544 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGMA-201ENST00000329082 11350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R14D-201ENST00000299174 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL592114.3-201ENST00000437919 446 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010967.3-201ENST00000438648 213 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073583.1-201ENST00000447553 400 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEFA10P-201ENST00000455014 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004947.1-202ENST00000457000 576 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC136628.1-201ENST00000503218 561 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010457.1-202ENST00000510137 337 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU4ATAC12P-201ENST00000516460 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms