RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.76□□□□□ -0.85
CLVS1-201ENST00000325897 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLVS1-201ENST00000325897 MYT1Q01538 1121 aa9.1□□□□□ -0.95
CLVS1-201ENST00000325897 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CLVS1-201ENST00000325897 SLC24A1O60721 1099 aa8.78□□□□□ -1
CLVS1-201ENST00000325897 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-201ENST00000325897 APLP2Q06481 763 aa8.52□□□□□ -1.05
CLVS1-201ENST00000325897 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.39□□□□□ -1.07
CLVS1-201ENST00000325897 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-201ENST00000325897 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.23□□□□□ -1.09
CLVS1-201ENST00000325897 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CLVS1-201ENST00000325897 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.22□□□□□ -1.09
CLVS1-201ENST00000325897 BCL11AQ9H165 835 aa8.18□□□□□ -1.1
CLVS1-201ENST00000325897 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CLVS1-201ENST00000325897 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.04□□□□□ -1.12
CLVS1-201ENST00000325897 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLVS1-201ENST00000325897 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.01□□□□□ -1.13
CLVS1-201ENST00000325897 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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CLVS1-201ENST00000325897 HRCP23327 699 aa7.97□□□□□ -1.13
CLVS1-201ENST00000325897 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CLVS1-201ENST00000325897 ABCC9O60706 1549 aa7.95□□□□□ -1.14
CLVS1-201ENST00000325897 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.86□□□□□ -1.15
CLVS1-201ENST00000325897 SCRIBQ14160 1630 aa7.84□□□□□ -1.15
CLVS1-201ENST00000325897 NACADO15069 1562 aa7.82□□□□□ -1.16
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CLVS1-201ENST00000325897 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
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CLVS1-201ENST00000325897 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.61□□□□□ -1.19
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CLVS1-201ENST00000325897 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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CLVS1-201ENST00000325897 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.54□□□□□ -1.2
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL34Q8N239 644 aa7.53□□□□□ -1.2
CLVS1-201ENST00000325897 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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CLVS1-201ENST00000325897 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CLVS1-201ENST00000325897 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.5□□□□□ -1.21
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM41Q8WV44 630 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-201ENST00000325897 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-201ENST00000325897 SMARCA4P51532 1647 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-201ENST00000325897 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-201ENST00000325897 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.46□□□□□ -1.22
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CLVS1-201ENST00000325897 HOMEZQ8IX15 550 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-201ENST00000325897 SMARCA2P51531 1590 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-201ENST00000325897 PDE4CQ08493 712 aa7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-201ENST00000325897 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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CLVS1-201ENST00000325897 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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CLVS1-201ENST00000325897 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-201ENST00000325897 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-201ENST00000325897 ABCC8Q09428 1581 aa7.29□□□□□ -1.24
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CLVS1-201ENST00000325897 FGD1P98174 961 aa7.25□□□□□ -1.25
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CLVS1-201ENST00000325897 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.23□□□□□ -1.25
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CLVS1-201ENST00000325897 NCAPD3P42695 1498 aa7.23□□□□□ -1.25
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CLVS1-201ENST00000325897 SOGA1O94964 1423 aa7.19□□□□□ -1.26
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CLVS1-201ENST00000325897 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-201ENST00000325897 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-201ENST00000325897 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-201ENST00000325897 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-201ENST00000325897 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-201ENST00000325897 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-201ENST00000325897 CFTRP13569 1480 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-201ENST00000325897 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.11□□□□□ -1.27
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