Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms