Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms