Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCND2-201ENST00000331113 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD5-201ENST00000333957 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RFFL-212ENST00000584655 4039 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A53-202ENST00000594199 6225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM12-204ENST00000446026 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003025.2-202ENST00000414466 4335 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM10-206ENST00000484800 3157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOBTB2-205ENST00000519685 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TUFT1-203ENST00000368849 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P1Y-201ENST00000306641 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P2Y-201ENST00000306853 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNK16-201ENST00000373227 789 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP172-201ENST00000411341 298 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021016.1-201ENST00000414167 498 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V1G1P3-201ENST00000442568 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL496P-201ENST00000470372 290 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E94P-201ENST00000502331 374 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MS4A15-204ENST00000528170 818 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CD3D-204ENST00000529594 422 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000785.2-201ENST00000531538 388 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SEBOX-201ENST00000536498 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFR2-206ENST00000591712 364 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H2BM-201ENST00000621112 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073255.1-201ENST00000624149 177 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP9-1-203ENST00000634358 330 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN7-201ENST00000309017 3765 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A4-202ENST00000447411 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPS-203ENST00000588776 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC183088.1-201ENST00000626622 3398 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1B-217ENST00000541869 5059 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LCMT1-AS2-201ENST00000562280 2601 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN3-217ENST00000634499 6069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX3-204ENST00000350526 3610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBBX-203ENST00000392766 3250 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL22-201ENST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms