Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NCAPHQ15003 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms