Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAOA-201ENST00000338702 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKG1-204ENST00000373985 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTOF-201ENST00000272371 7156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOPEY2-202ENST00000399151 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTNAP3B-211ENST00000612828 7455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01163-202ENST00000630252 3086 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CR786580.1-201ENST00000417843 2878 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLDCP1-201ENST00000510885 2678 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYH13-202ENST00000418404 6067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPYL4-201ENST00000420283 4180 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRIP3-201ENST00000274990 800 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP349-201ENST00000363743 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA71C-201ENST00000364642 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR623-201ENST00000384986 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP29-201ENST00000410988 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121999.1-201ENST00000420156 332 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX293535.1-201ENST00000443579 283 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01883-201ENST00000457385 380 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL50P-201ENST00000461146 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL566P-201ENST00000467650 296 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL698P-201ENST00000480095 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL141P-201ENST00000484215 266 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC133435.1-201ENST00000498753 576 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112173.1-201ENST00000505876 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP9-12P-201ENST00000514388 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDGF1P5-201ENST00000523009 453 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105219.3-201ENST00000527579 374 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009060.2-201ENST00000569264 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3918-201ENST00000581555 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024619.3-201ENST00000582196 323 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL378P-201ENST00000582657 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFL1P2-201ENST00000593820 330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007216.5-201ENST00000612457 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 uc_338.3-201ENST00000613268 181 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.140-201ENST00000613842 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138932.4-201ENST00000619102 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138969.4-201ENST00000620593 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL118508.2-201ENST00000622708 673 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAS3-233ENST00000626960 227 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAF1-202ENST00000540010 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCG1-204ENST00000398437 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011365.1-201ENST00000522615 3478 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGA10-202ENST00000612503 4462 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590132.1-201ENST00000639602 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CATSPERG-204ENST00000410018 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNDP1-203ENST00000582365 4111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC33-203ENST00000398814 2787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A7A-203ENST00000368729 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPS1-211ENST00000520276 4083 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHEK1-213ENST00000532449 4051 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113554.2-201ENST00000577647 4862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms