Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PIP4K2C-201ENST00000354947 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LHX4-201ENST00000263726 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC100788.2-201ENST00000625199 2889 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 STK36-201ENST00000295709 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC2P8-202ENST00000564334 3705 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA1-202ENST00000517417 4604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF438-204ENST00000413025 3106 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A53-202ENST00000594199 6225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GBA-201ENST00000327247 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-7P-201ENST00000364105 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 APOM-203ENST00000375920 709 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CST9LP1-201ENST00000376987 444 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV3-27-201ENST00000390304 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL757P-201ENST00000466709 301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPCP16-201ENST00000506029 210 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RPPH1-3P-201ENST00000516541 322 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ALG1L9P-205ENST00000532875 549 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3185-201ENST00000583892 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF5AP3-201ENST00000589460 462 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.2 ms