Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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