Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms