Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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NFE2L3Q9Y4A8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L3Q9Y4A8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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