Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD4AQ9UPU9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms