Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3Q9UPQ7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms