Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC12A4Q9UP95 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC12A4Q9UP95 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC12A4Q9UP95 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC12A4Q9UP95 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A4Q9UP95 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms