Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF18Q9UNG2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms