Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms