Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms