Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSKSQ9UJT2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSKSQ9UJT2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms