Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSR3Q9UJK0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSR3Q9UJK0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms