Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms