Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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