Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWAP70Q9UH65 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms