Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VTI1BQ9UEU0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms