Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms