Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9Q9P2J2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms