Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms