Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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