Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms