Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms