Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms