Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms