Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SERINC1Q9NRX5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms