Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM1Q9NRU3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms