Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPOLBQ9NRJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms