Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4Q9NQC3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms