Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms