Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms