Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP3Q9H9T3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms