Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP4Q9H6H4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
REEP4Q9H6H4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REEP4Q9H6H4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REEP4Q9H6H4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REEP4Q9H6H4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REEP4Q9H6H4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REEP4Q9H6H4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REEP4Q9H6H4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms