Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms