Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms