Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
YTHDF1Q9BYJ9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms