Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms