Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTKNQ9BST9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms