Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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