Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LARP6Q9BRS8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms